MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022784	TGC	2	6	274284	274289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625495
3502	NC_022784	ATA	2	6	274300	274305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625495
3503	NC_022784	AGAT	2	8	274394	274401	50 %	25 %	25 %	0 %	557625495
3504	NC_022784	TA	3	6	274460	274465	50 %	50 %	0 %	0 %	557625495
3505	NC_022784	G	6	6	274474	274479	0 %	0 %	100 %	0 %	557625495
3506	NC_022784	TGT	2	6	274530	274535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625495
3507	NC_022784	GAA	2	6	274600	274605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625495
3508	NC_022784	TGA	2	6	274635	274640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625495
3509	NC_022784	TTC	2	6	274670	274675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625495
3510	NC_022784	GGC	2	6	274734	274739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625495
3511	NC_022784	TCG	2	6	274745	274750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625495
3512	NC_022784	AAGGG	2	10	274761	274770	40 %	0 %	60 %	0 %	557625495
3513	NC_022784	TGT	2	6	274850	274855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625495
3514	NC_022784	T	6	6	274873	274878	0 %	100 %	0 %	0 %	557625495
3515	NC_022784	AGGG	2	8	274881	274888	25 %	0 %	75 %	0 %	557625495
3516	NC_022784	GC	3	6	274901	274906	0 %	0 %	50 %	50 %	557625495
3517	NC_022784	AGG	2	6	275267	275272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625496
3518	NC_022784	AGG	2	6	275333	275338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625496
3519	NC_022784	TTCT	2	8	275444	275451	0 %	75 %	0 %	25 %	557625496
3520	NC_022784	CTT	2	6	275515	275520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625496
3521	NC_022784	GA	3	6	275558	275563	50 %	0 %	50 %	0 %	557625496
3522	NC_022784	ATG	2	6	275582	275587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625496
3523	NC_022784	GCC	2	6	275600	275605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625496
3524	NC_022784	CTG	2	6	275716	275721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625496
3525	NC_022784	TGCC	2	8	275749	275756	0 %	25 %	25 %	50 %	557625496
3526	NC_022784	GCG	2	6	275807	275812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625496
3527	NC_022784	ATA	2	6	275821	275826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625496
3528	NC_022784	ACG	2	6	275831	275836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625496
3529	NC_022784	AT	3	6	275878	275883	50 %	50 %	0 %	0 %	557625496
3530	NC_022784	AGA	2	6	275890	275895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625496
3531	NC_022784	AGG	2	6	275925	275930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625496
3532	NC_022784	T	6	6	275976	275981	0 %	100 %	0 %	0 %	557625496
3533	NC_022784	TCT	2	6	276035	276040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625496
3534	NC_022784	AAG	2	6	276043	276048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625496
3535	NC_022784	GTG	2	6	276060	276065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625496
3536	NC_022784	AGA	2	6	276067	276072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625496
3537	NC_022784	AAG	2	6	276119	276124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625496
3538	NC_022784	T	6	6	276190	276195	0 %	100 %	0 %	0 %	557625496
3539	NC_022784	TAA	2	6	276219	276224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625496
3540	NC_022784	CTG	2	6	276463	276468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625497
3541	NC_022784	GA	3	6	276478	276483	50 %	0 %	50 %	0 %	557625497
3542	NC_022784	ACGT	2	8	276519	276526	25 %	25 %	25 %	25 %	557625497
3543	NC_022784	CTT	2	6	276575	276580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625497
3544	NC_022784	ATG	2	6	276583	276588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625497
3545	NC_022784	TCA	2	6	276619	276624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625497
3546	NC_022784	TTG	2	6	276640	276645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625497
3547	NC_022784	GTT	2	6	276703	276708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625497
3548	NC_022784	GCA	2	6	276751	276756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625497
3549	NC_022784	T	6	6	276769	276774	0 %	100 %	0 %	0 %	557625497
3550	NC_022784	TGA	2	6	276776	276781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625497
3551	NC_022784	ACC	2	6	276786	276791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625497
3552	NC_022784	C	6	6	276801	276806	0 %	0 %	0 %	100 %	557625497
3553	NC_022784	AC	3	6	276828	276833	50 %	0 %	0 %	50 %	557625497
3554	NC_022784	GAA	2	6	276864	276869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625497
3555	NC_022784	CTC	2	6	276962	276967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625497
3556	NC_022784	CGC	2	6	276980	276985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625497
3557	NC_022784	ACTTC	2	10	277036	277045	20 %	40 %	0 %	40 %	557625497
3558	NC_022784	TGC	2	6	277114	277119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625497
3559	NC_022784	GTTC	2	8	277121	277128	0 %	50 %	25 %	25 %	557625497
3560	NC_022784	AGCA	2	8	277133	277140	50 %	0 %	25 %	25 %	557625497
3561	NC_022784	TGA	2	6	277223	277228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625497
3562	NC_022784	A	7	7	277268	277274	100 %	0 %	0 %	0 %	557625497
3563	NC_022784	CCA	2	6	277298	277303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625497
3564	NC_022784	CTCAGC	2	12	277320	277331	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	557625497
3565	NC_022784	AG	3	6	277358	277363	50 %	0 %	50 %	0 %	557625497
3566	NC_022784	GA	3	6	277413	277418	50 %	0 %	50 %	0 %	557625497
3567	NC_022784	CTTGC	2	10	277455	277464	0 %	40 %	20 %	40 %	557625497
3568	NC_022784	CG	3	6	277490	277495	0 %	0 %	50 %	50 %	557625497
3569	NC_022784	TGAC	2	8	277571	277578	25 %	25 %	25 %	25 %	557625497
3570	NC_022784	CAA	2	6	277604	277609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625497
3571	NC_022784	TA	3	6	277630	277635	50 %	50 %	0 %	0 %	557625497
3572	NC_022784	CA	3	6	277923	277928	50 %	0 %	0 %	50 %	557625498
3573	NC_022784	TGA	2	6	277958	277963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625498
3574	NC_022784	CTG	2	6	278078	278083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3575	NC_022784	T	7	7	278210	278216	0 %	100 %	0 %	0 %	557625498
3576	NC_022784	A	6	6	278226	278231	100 %	0 %	0 %	0 %	557625498
3577	NC_022784	GT	3	6	278311	278316	0 %	50 %	50 %	0 %	557625498
3578	NC_022784	GCT	2	6	278349	278354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3579	NC_022784	AGC	2	6	278356	278361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3580	NC_022784	ATG	2	6	278366	278371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625498
3581	NC_022784	CTG	2	6	278402	278407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3582	NC_022784	TAT	2	6	278478	278483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625498
3583	NC_022784	CTG	2	6	278581	278586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3584	NC_022784	CAA	2	6	278628	278633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625498
3585	NC_022784	TGC	2	6	278696	278701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625498
3586	NC_022784	AGA	2	6	278745	278750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625498
3587	NC_022784	TG	3	6	278852	278857	0 %	50 %	50 %	0 %	557625498
3588	NC_022784	TGGTAT	2	12	278901	278912	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	557625498
3589	NC_022784	GAA	2	6	279275	279280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625499
3590	NC_022784	TGT	2	6	279289	279294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625499
3591	NC_022784	ACC	2	6	279324	279329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625499
3592	NC_022784	CAC	2	6	279347	279352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625499
3593	NC_022784	CAC	2	6	279362	279367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625499
3594	NC_022784	TCG	2	6	279465	279470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625499
3595	NC_022784	GGC	2	6	279510	279515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625499
3596	NC_022784	CAG	2	6	279595	279600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625499
3597	NC_022784	CCG	2	6	279619	279624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625499
3598	NC_022784	GAG	2	6	279625	279630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625499
3599	NC_022784	CTG	3	9	279635	279643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625499
3600	NC_022784	AACC	2	8	279653	279660	50 %	0 %	0 %	50 %	557625499
3601	NC_022784	TCC	2	6	279679	279684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625499
3602	NC_022784	CTTTT	2	10	279757	279766	0 %	80 %	0 %	20 %	557625499
3603	NC_022784	GAC	2	6	279773	279778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625499
3604	NC_022784	CCCG	2	8	279789	279796	0 %	0 %	25 %	75 %	557625499
3605	NC_022784	GGAAC	2	10	279819	279828	40 %	0 %	40 %	20 %	557625499
3606	NC_022784	ACC	2	6	279905	279910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625499
3607	NC_022784	GTT	2	6	279950	279955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625499
3608	NC_022784	TAT	2	6	280007	280012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625499
3609	NC_022784	ACA	2	6	280049	280054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625499
3610	NC_022784	ACC	2	6	280060	280065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625499
3611	NC_022784	CAC	2	6	280097	280102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625500
3612	NC_022784	CCT	2	6	280118	280123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625500
3613	NC_022784	CT	3	6	280164	280169	0 %	50 %	0 %	50 %	557625500
3614	NC_022784	AT	3	6	280188	280193	50 %	50 %	0 %	0 %	557625500
3615	NC_022784	GCT	2	6	280394	280399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625500
3616	NC_022784	CTC	2	6	280426	280431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625500
3617	NC_022784	GT	3	6	282626	282631	0 %	50 %	50 %	0 %	557625501
3618	NC_022784	TA	3	6	282647	282652	50 %	50 %	0 %	0 %	557625501
3619	NC_022784	CTA	2	6	282767	282772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625501
3620	NC_022784	AGTT	2	8	282780	282787	25 %	50 %	25 %	0 %	557625501
3621	NC_022784	GA	3	6	282892	282897	50 %	0 %	50 %	0 %	557625501
3622	NC_022784	GTT	2	6	282979	282984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625501
3623	NC_022784	AAG	2	6	283039	283044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625501
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3737	NC_022784	ATG	2	6	290338	290343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625508
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3745	NC_022784	GCCT	2	8	290693	290700	0 %	25 %	25 %	50 %	557625508
3746	NC_022784	ATG	2	6	290739	290744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625508
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3748	NC_022784	GA	3	6	290884	290889	50 %	0 %	50 %	0 %	557625508
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3753	NC_022784	ACTC	2	8	291054	291061	25 %	25 %	0 %	50 %	557625509
3754	NC_022784	GGTT	2	8	291128	291135	0 %	50 %	50 %	0 %	557625509
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3757	NC_022784	TGGA	2	8	291271	291278	25 %	25 %	50 %	0 %	557625509
3758	NC_022784	CGT	2	6	291280	291285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625509
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3762	NC_022784	T	6	6	291471	291476	0 %	100 %	0 %	0 %	557625509
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3853	NC_022784	TGAC	2	8	304449	304456	25 %	25 %	25 %	25 %	557625513
3854	NC_022784	TCC	2	6	304542	304547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625513
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3859	NC_022784	GCA	2	6	304656	304661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625513
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3863	NC_022784	GCAT	2	8	304875	304882	25 %	25 %	25 %	25 %	557625513
3864	NC_022784	TGC	2	6	304932	304937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625513
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3992	NC_022784	TGCCG	2	10	334869	334878	0 %	20 %	40 %	40 %	557625521
3993	NC_022784	GA	3	6	334903	334908	50 %	0 %	50 %	0 %	557625521
3994	NC_022784	GA	3	6	334914	334919	50 %	0 %	50 %	0 %	557625521
3995	NC_022784	GCA	2	6	334943	334948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625521
3996	NC_022784	GCT	2	6	334989	334994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625521
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